محبوب‌ترين مانگاي دنيا شونن جامپ ناروتو ناروتو در حال تمرين براي نينجا شدن است. او هم‌تيمي‌هايش را سرگرم مي‌كند. درواقع ناروتو درمورد يك چيز بسيار مصمم است: تبديل شدن به بهترين نينجاي دنيا! ناروتو اوزوماكي دوازده سال پيش دهكده‌اي كه در بين برگ‌هاي درختان مخفي شده‌بود، مورد حمله‌ي وحشيانه‌اي قرارگرفت و روح يك روباه نه‌دم، جان رهبر دهكده، هوكاگه، و ساير ساكنان آن‌را گرفت. امروز دهكده در آرامش است و يك پسر بچه‌ي دردسرساز در حال آموزش نينجا شدن از آكادمي نينجا است. هدف اون اين است كه مانند هوكاگه شود، اما سرنوشت واقعي او پيچيده‌تر از اين است و ماجرا از همين‌جا شروع مي‌شود.