محبوب‌ترین مانگای دنیا شونن جامپ ناروتو ناروتو در حال تمرین برای نینجا شدن است. او هم‌تیمی‌هایش را سرگرم می‌کند. درواقع ناروتو درمورد یک چیز بسیار مصمم است: تبدیل شدن به بهترین نینجای دنیا! ناروتو اوزوماکی دوازده سال پیش دهکده‌ای که در بین برگ‌های درختان مخفی شده‌بود، مورد حمله‌ی وحشیانه‌ای قرارگرفت و روح یک روباه نه‌دم، جان رهبر دهکده، هوکاگه، و سایر ساکنان آن‌را گرفت. امروز دهکده در آرامش است و یک پسر بچه‌ی دردسرساز در حال آموزش نینجا شدن از آکادمی نینجا است. هدف اون این است که مانند هوکاگه شود، اما سرنوشت واقعی او پیچیده‌تر از این است و ماجرا از همین‌جا شروع می‌شود.