کتاب چهل سال تاريخ ايران در سه جلد تدوين شده است. جلد اول آن المآثر و الآثار است که مندرجات آن عبارتند از: متن کتاب، جمع و خرج مملکت و سالنامه. جلد دوم آن يادداشت‌ها و تعليقات حسين محبوبي اردکاني است بر المآثر و الآثار در احوال رجال دوره و دربار ناصري و جلد سوم آن فهرست‌هاي چندگانه تاريخي، جغرافيايي و مدني است.