سوفي براي ديدن دوست تازه‌اش، سيتا، به سيرک مي‌رود. توي سيرک، خرگوش عروسکي مورد علاقه‌اش، فليکس، غيبش مي‌زند و هيچ اثري از او پيدا نمي‌شود. يک هفته بعد، نامه‌ي مرموزي از فليکس به دست سوفي مي‌رسد. خرگوش کوچولو توي نامه نوشته است که او را دزديده‌اند و به اين ترتيب سفر پرهيجان و ماجراجويانه‌ي خرگوش کوچولو با سيرک بارلي شروع مي‌شود.